Pathogen Fast Identification
宏基因組測序mNGS(metagenome Next Generation Sequencing)—— 是指對特定樣品中的全部病原體基因組進行高通量測序,該方法能夠快速、準確、高效地獲得整個病原體群體的基因組信息。宏基因組測序不依賴于病原體的分離培養,可以得到樣品中豐度較低甚至是痕量病原體的信息。近年來,宏基因組測序越來越多的應用于醫學和獸醫研究及臨床診斷領域。
VETKNOW動物病原宏基因組分析系統是專門針對動物病原微生物宏基因組數據分析的軟件。VETKNOW有 自行研發的數據庫,數據庫收錄了包含獸醫常見病原微生物在內的8000種病毒,30000種細菌(包含分枝桿 菌、支原體/衣原體和螺旋體),及豬牛羊雞鴨鵝犬貓等宿主信息。分析結果可顯示病原、比對序列數
(reads),物種分類及農業農村部一二三類動物疫病信息等。
本地VETKNOW擁有以下特點:
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1、專注獸醫:獸醫病原專有數據庫,更加專業
2、界面簡潔:圖形化界面,更加簡潔
3、數據安全:獨立賬戶,保證數據安全
4、速度更快:專有服務器,算法先進,比對速度更快
5、操作簡單:只需上傳數據,“一鍵式”分析和生成報告,無需敲代碼
6、本地安裝:無需聯網,無需激活碼,可進行無限次測序
7、兼容性好:兼容illumination和ONT測序下機數據
8、功能強大:可對比對結果進行統計分析和可視化